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單細胞基因組學和調控網(wǎng)絡取得新進展,支原體祛除噴霧助力科研

更新時間:2024-06-02  |  點擊率:565

單細胞基因組學是一個精密的科研學科,每一個單獨的細胞都彌足珍貴,包含著多樣的遺傳信息,是打開生命科學一把鑰匙。在進行單細胞基因組學的實驗室中,確保實驗環(huán)境的純凈、避免細胞污染十分重要。德國MB公司生產(chǎn)的Mycoplasma Off,高效清除實驗環(huán)境中的支原體、細菌等微生物污染

 

單細胞基因組學提供了一種強大的方法來了解變異如何影響基因表達,特別是在人類大腦中眾多細胞類型中。此外,它可能會改善我們對大腦相關特征的調節(jié)機制的理解。然而,需要具有廣泛腦表型的群體規(guī)模隊列來推斷變體之間的關鍵關聯(lián),并在單細胞規(guī)模上開發(fā)調節(jié)模型。

 

近日,科研人員為了解決這個問題,對受實驗者進行了許多單細胞實驗[單核RNA測序(snRNA-seq)、snATAC-seq (ATAC,轉座酶可及染色質測定)snMultiome +基因分型]和前額葉皮層樣本的計算分析。

 

相關研究成果發(fā)表在《Science》上,文章標題為:“Single-cell genomics and regulatory networks for 388 human brains"??蒲腥藛T使用單核RNA測序 (snRNA-seq)、單核ATAC-seq測序及單核Multiome測序,并結合基因分型和計算分析,對含超過280萬個單細胞核在內的388份人腦前額葉皮層樣本進行了深度測序,并結合深度學習模型、eQTL (表達數(shù)量性狀位點),構建了細胞類型特異性的基因調控和細胞間通訊網(wǎng)絡,揭示了不同細胞類型在老齡化和神經(jīng)精神疾病中的特定改變。

 

該項研究的人類大腦的人口規(guī)模單細胞資源,可以幫助促進神經(jīng)精神疾病的精確醫(yī)學方法,特別是通過優(yōu)先考慮與細胞類型相關的后續(xù)基因和藥物靶點。


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